鸡球虫病对雏鸡和育成鸡的危害十分严重，15～50日龄的雏鸡发生率高，死亡率可达80％以上。耐过的雏鸡生长缓慢，发育不良。成鸡多为带虫者，增重量和产蛋受到一定影响。
一、症状
1.急性型急性型病程为2～3周，多见于雏鸡。发病初期精神沉郁，羽毛松乱，不爱活动；食欲废绝，鸡冠及可视粘膜苍白，逐渐消瘦；排水样稀便，并带有少量血液。若是盲肠球虫，则粪便呈棕红色，以后变成血便。雏鸡死亡率高达100％。
2.慢性型慢性型多见于2～4个月龄的雏鸡或成鸡，症状类似急性型，但不大明显。病程也较长，拖至数周或数月。病鸡逐渐消瘦，产蛋减少，间歇性下痢，但较少死亡。
二、病理变化
死鸡消瘦，粘膜和鸡冠苍白或发青，泄殖腔周围羽毛被粪便污染，往往带有血液。内脏的主要变化在肠道，肠道病理变化的部位和程度与病原种类有关。柔嫩爱美耳球虫主要侵害盲肠，急性型时两根盲肠显著肿大3～5倍，肠内充满凝固的或暗红色血液，肠上皮变厚并有糜烂，直肠粘膜可见有出血斑。毒害爱美耳球虫损害小肠中段，这部分肠管扩张、肥厚、变粗，严重坏死。肠管中有凝固血块，使小肠在外观上呈现淡红色或黄色。巨型爱美耳球虫主要侵害小肠中段，肠管扩张，肠壁肥厚，内容物粘稠，呈淡灰色、淡褐色或淡红色，有时混有很少的血。堆型爱美耳球虫多在上皮表层发育，而且同期发育阶段的虫体常聚集在一起。因此被损害的十二指肠和小肠前段出现大量淡灰色斑点，排列成横行，外观呈阶梯样。哈氏爱美耳球虫主要损害十二指肠和小肠前段，特征性变化是肠壁上出现针头大小的红色圆形出血点。
